没有影响，就算有了土地证，办理房产证时也要把土地证收回的，一般来讲你的房产证上会写明土地使用面积的。房产证的含义就是是房产与及所占土地的共同权利（地上建筑与地下空间是不可割裂的）。
自家建的房子，是集体土地？还是国有？国有的系重建，土地证作用不是很大；集体土地要改变成宅基地性质。
遇到拆迁的话，有麻烦。
