按法律规定，法院进行查封不需要单位同意。
《中华人民共和民事诉讼法》第二百四十五条 人民法院查封、扣押财产时，被执行人是公民的，应当通知被执行人或者他的成年家属到场；被执行人是法人或者其他组织的，应当通知其法定代表人或者主要负责人到场。拒不到场的，不影响执行。被执行人是公民的，其工作单位或者财产所在地的基层组织应当派人参加。
对被查封、扣押的财产，执行员必须造具清单，由在场人签名或者盖章后，交被执行人一份。被执行人是公民的，也可以交他的成年家属一份。
不叫查封，应叫冻结。无需单位同意，但冻结工资不能全部冻结，必须留足一定的生活费用。作为单位，必须协助冻结，否则单位负责人可能会被罚款甚至拘留。如果全部冻结工资，被告获被执行人可以提出异议。
一旦法院作出决定查封相应帐号，都是公司予以配合。因此只需通知单位即可，无需单位同意。
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