24/07 238 背叛的街角
24/08 239 漆黑的丧葬行列
24/09 240 不告而别
24/10 241 来自过去的子弹
24/11 242 白色世界
29/03 287 看不见的恐怖
29/04 288 危险讯号
29/05 289 光天化日下的埋
34/11 350 金苹果①
35/01 351 金苹果②
35/02 352 金苹果③
35/03 353 金苹果④
35/04 354 金苹果⑤
37/05 377 黑暗的足迹①
37/06 378 黑暗的足迹②
37/07 379 黑暗的足迹③
37/08 380 白雪…黑影…
37/09 381 危险的相遇
37/10 382 顺风车
38/01 383 新兵器！
41/10 423 到访者留下的谜
41/11 424 小小密室的秘密
42/01 425 隐藏的真相
42/05 429 月圆之夜和黑宴
42/06 430 染血的幽灵船
42/07 431 隐形人出现
42/08 432 工藤新一登场
42/09 433 面具下的真相
42/10 434 腐坏的苹果
46/07 475 封印
48/09 499 门铃怪客
48/10 500 新黑衣人
49/01 501 追踪目标
49/02 502 新的指令
49/03 503 黑衣组织vsFBI ①
49/04 504 黑衣组织vsFBI ②
53/07 550 目击者一人
53/08 551 钉子与蛇
53/09 552 锤子的真面目
53/10 553 不可思议的兼职
54/01 554 晚餐的菜单
54/02 555 梦中之星
57/09 595 乌鸦之歌
57/10 596 第二条线
57/11 597 假患者
58/01 598 跟踪，然后……
58/02 599 赤井的过去
58/03 600 孤注一掷
58/04 601 伪装
58/05 602 最终手段
58/06 603 任务
58/07 604 姐弟
58/08 605 意外的嫌疑人
58/09 606 13日又是星期五
58/10 607 卡迈尔的过去
58/11 608 魔法的咒语
59/01 609 钢楔
60/03 622 红白黄色
60/04 623 黑白君
60/05 624 新邻居
64/01 664 一角岩
64/03 666 杀气
65/03 677 命运之人
65/04 678 陷阱
65/05 679 摇摆的心
65/06 680 与危险的二人同行
67/03 699 期待明天
67/04 700 危险地带
67/05 701 赤与13的暗示
67/06 702 炸弹犯的目的
67/07 703 暴风雪中的真相
67/08 704 寂静的战争
72/04 755 通话代码
74/02 775 视频网站
74/03 776 罐子和猫
74/04 777 步美的痕迹
75/09 793 私家侦探
75/10 794 遗传信息
75/11 795 回归于火焰的命运
76/01 796 相约科伦坡
76/02 797 错综复杂的谎言与谜题
76/03 798 侦探们的夜想曲
76/04 799 小孩的好奇心和侦探的探究心
76/05 800 立体交错的思绪
76/06 801 完全不笑的人
76/07 802 别摆出那副表情
76/09 804 高木警官送来的礼物
未出单行本漫画
File.808 迟到的扫墓
File.815 自己的地盘
File.817 灯下的孤影
File.818 神秘列车（启程）
File.819 神秘列车（隧道）
File.820 神秘列车（一等）
File.821 神秘列车（交叉）
File.822 神秘列车（拦截）
File.823 神秘列车（冒烟）
File.824 神秘列车（终点）
File.825 特别教练[7]
File.826 消失的密室钥匙
File.827 解谜的钥匙
剧场版 M 5《通往天国的倒计时》（天国へのカウントダウン）2001/04/11
M 13《漆黑的追踪者》（漆�\の追迹者） 2009/04/18
真人版 单发第二部 工藤新一的复活 黑暗组织的对决
TV 版
001 云霄飞车杀人事件
054 电玩公司杀人事件
128 黑衣组织十亿元抢劫事件
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件
176 与黑暗组织的再会（灰原篇）
177 与黑暗组织的再会（柯南篇）
178 与黑暗组织的再会（解决篇）
230 迷一样的乘客（前篇）
231 迷一样的乘客（后篇）
271 隐藏匆忙中的省略（前篇）
272 隐藏匆忙中的省略（后篇）
286 工藤新一NY事件（事件篇）
287 工藤新一NY事件（推理篇）
288 工藤新一NY事件（解决篇)
307 遗留的无声证言（前篇）
308 遗留的无声证言（后篇）
309 与黑暗组织的接触（交涉篇）
310 与黑暗组织的接触（追迹篇）
311 与黑暗组织的接触（决死篇）
338 四台保时捷（前篇）
339 四台保时捷（后篇）
340 厕所隐藏的秘密（前篇）
341 厕所隐藏的秘密（后篇）
345 与黑暗组织的直面对决 满月之夜的二元推理
425 黑色的冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间
462 黑暗组织的影子 年幼的目击者
463 黑暗组织的影子 奇妙的照明
464 黑暗组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑暗组织的影子 珍珠的流星
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞遗言
501 红与黑碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
563 侦探团VS劫匪团 骚动
564 侦探团VS劫匪团 沉默
578 召唤危机的红色前兆
579 黑色13的暗示
580 逼近的黑之时限
581 摇曳的红色目
667 婚礼前夜（前篇）
668 婚礼前夜（后篇）
671 侦探们的夜想曲（案件）
672 侦探们的夜想曲（绑架）
673 侦探们的夜想曲（推理）
674 侦探们的夜想曲（波本）
675 毫不原谅（前篇)
676 毫不原谅（后篇）
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