十三陵位于北京，是从北迁的永乐皇帝开始之后的明代十三个皇帝的坟墓。
而之前的两个皇帝，朱元璋和马皇后合葬于当时的都城南京，为现在的明孝陵。
第二个皇帝建文帝是朱元璋的孙子，在明成祖攻占南京的靖难之役中失踪。
明孝陵坐落于江苏省南京市钟山南麓玩珠峰下，为明朝（公元1368年至1644年）开国皇帝朱元璋和皇后马氏的合葬陵墓。作为中国明陵之首的明孝陵壮观宏伟，代表了明初建筑和石刻艺术的最高成就，直接影响了明清两代500多年帝王陵寝的形制。依历史进程分布于北京、湖北、辽宁、河北等地的明清帝王陵寝，都是按南京明孝陵的规制和模式营建的。
1、朱元璋和他老婆的陵墓在南京的明孝陵，因为朱元璋在南京建立明朝。因皇后马氏谥“孝慈”，故名孝陵。
2、还有两个没在十三陵的明朝皇帝是：建文帝、明代宗。
建文帝朱允炆失踪，无帝陵。
明代宗则葬于北京西郊金山下。估计是明英宗重夺帝位后不满代宗之前曾夺去他的皇位（土木堡之变）。
十三陵是在朱棣在北京建都后，才开始修建的，因此没有朱元璋
明朝的皇帝里面是朱元璋以及建文帝不在北京的十三陵
朱元璋的皇陵在南京明孝陵
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