A、在生命起源的研究中，已经得到科学实验证实的是从无机小分子物质生成有机小分子物质，A错误；B、胚珠数目决定种子数目，B错误；C、兔的黑毛和长毛不是一对相对性状，因为黑毛和长毛不属于同一性状，C错误；D、禁止近亲结婚可有效的预防遗传性疾病发生，D正确；故选：D
