厦门到深圳没有直达火车，但是有一班厦门到广州东的K298次快速列车，经停惠州和东莞东，17:13从厦门发车。建议到东莞东下车，时间为清晨的6:06。东莞去深圳的车多如牛毛。
截止到2017年1月25日，厦门到深圳共有45趟列车，以下是列车时刻表：
