不用担心。
1.现在在手的发票仍然可以开具，税务没有正式变更征纳方式前，还是按原来的增收率征收增值税。
2.因为你上年开票额已经超过80万元了，估计税务局是要你转为增值税一般那说人了。所以需要注销原个体工商户的税务登记证，改为一般纳税人后，一般按照17%的税率执行，但是你可以抵扣进项税金了，总体税负不是就一定会超过你原来的3%的，主要看你的进项税金多不多了。
3.变更为一般纳税人是很正常的税务事项，应该是你公司壮大了的表现，是好事情，不会罚款的。
应该不是注销，是让你申请一般纳税人，现在可以开票但不是按3%了，是按17%，没应罚款
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