A、有的物质的分子比有的物质的原子大，有的物质的原子比有的物质的分子大，所以分子和原子不能比较大小，故A错；B、由分子构成的物质，保持物质化学性质的最小粒子是分子，由原子构成的物质，保持物质化学性质的最小粒子是原子，故B错；C、构成物质的基本微粒是分子、原子、离子，故C正确；D、物质状态发生变化属于物理变化，粒子大小不变，变化的是粒子之间的间隔，故D错．故选C．
