医院前身是中国人民解放军第四六六医院，成立于1951年，2006年1月更名为空军航空医学研究所附属医院，是一所集医疗、教学、科研、医学训练、健康鉴定为一体的综合性三级甲等医院，是北京市首批医疗保险定点医院、第四军医大学教学医院、北京市狂犬病免疫预防定点医院。空军航空医学研究所是国内唯一从事航空医学理论与应用研究，实施飞行人员医疗康复、航空生理心理训练的医学科研单位，累计开展科研课题700余项，获国家、军队科技进步奖362项，其中军队科技进步二等奖以上高等级成果88项，国家发明奖7项。研究所现有医学科研人员300余名，临床医学技术人员600余名，其中著名生物医学工程专家俞梦孙主任为中国工程院院士、空军首席专家、博士生导师。
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