A、转基因技术指的是：把一个生物体的基因转移到另一个生物体DNA中的生物技术．所以将抗除草剂基因转入小麦DNA中，他利用的生物技术是转基因技术．故符合题意．
B、用黑曲霉发酵产生柠檬酸是微生物的发酵，故不符合题意．
C、利用某些微生物生产木瓜蛋白酶是微生物的发酵作用，故不符合题意．
D、利用杂交技术培育出抗倒伏、抗锈病的小麦新植株是基因的多样性，原理：基因重组．方法：将多个品种性状经过选择培育的方法．故不符合题意．
故选：A．
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