聚丙烯酰胺电泳有十几条带，其实这些条带大多数都是非目标序列。是因为引物与基因组其他位置也进行了结合进行了PCR。
SSR正常情况只有2条带是不对的。哪怕换成目标条带就2条也不对。我的经验来说，因为可能你的扩增引物会有几个有效的结合位点，有时候会出现好几条带（一般2-3，有时候也有影子带）。但是SSR从原理上来讲，应该是有两套类型（两套染色体，又叫等位基因），当然如果是个纯合子，两套就会跑到一起了，从电泳距离来说是区分不出来等位基因的。
其实有时候在进行SSR多态性检测的时候，也可以看看条带的亮度。
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