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不会清零。缴纳中断不超过3个月的，可以补缴，累计计算，但停交期间不能享受医保待遇；缴纳中断超过3个月的，不得补缴，只能重交，也累计计算。医保缴费和待遇享受相关，企业在职人员在参保缴费的下月起就可以正常享受医疗保险待遇，停保后相关医疗保险待遇也停止，但系统数据和缴费年限不会清零。
