有没有用endnote？有的话直接在endnote里面设置参考文献在正文中的引用格式为数字上标。没有的话，就只有笨一点的办法了按住ctrl键复选，把所有需要上标的文字分别全部选中，然后一次性的在格式里面选上标还有一种，word有模糊查找的功能，可不可以定义[？]查找替换为上标格式的？？去研究一下。
