退税其实就是退抵扣的进项，如果最后留抵和当期进项之和小于当期销项和进项转出之和，那就意味着需要缴税。你理解的没错，留抵5万，进项3万，进项转出10万，意味着需要缴纳增值税2万，出口的其他分录不用做，就做一笔不予抵扣的进项税额转出即可。当期进项小于销项，也同样做一笔不予抵扣进项转出即可，做不予抵扣进项税转出是不管当期其他事项的，不管留抵还是缴税，都要做的。
你说的没错，不予抵扣部分是因为征退税之差造成的，应该转入销售成本。因为进项税额-销项税额+上期留抵税额=负值，增值税纳税申报表里面就会产生应纳税额，反之则结转下期继续留抵。
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