1、遗传性，可见于遗传性小脑共济失调、橄榄桥小脑萎缩等疾病。
2、脑部长期供血不足如由于脑动脉粥样硬化造成小脑慢性缺血缺氧，逐渐发生小脑萎缩。
3、中毒，可以是治疗疾病的药物副作用如治疗癫痫的苯妥英钠，也可以是长期饮酒造成小脑细胞中毒损害继而萎缩。
4、脑血管疾病，小脑的出血或者梗死，当血肿或者梗死灶吸收后逐渐被胶原纤维代替引起小脑萎缩。
5、感染，病原微生物入侵脑部影响到小脑也可以造成后期的萎缩改变。
6、先天发育障碍，女性怀孕期间受到一些外界因素影响如苯、重金属、空气污染、病毒感染等使脑部发育受到影响可导致小脑萎缩。
引起小脑萎缩的病因主要分为两大方面，第一是由于本身出现有局部组织不可逆性的病理改变问题，比如年龄增大或者本身出现局部的损伤容易导致这种现象。第二考虑是由于存在脑循环障碍的问题，脑组织长时间缺血缺氧容易出现萎缩的情况，后期容易产生有功能障碍的问题，早期主要会出现有头痛头晕的症状。
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