阿坝州州府在马尔康的主要原因如下：
1、马尔康地处全州腹心地带，地理位置适中，其经济带动和辐射效应较明显。
2、拥有保存完整的藏族文化形态，境内同时有安多和嘉绒两个藏族支系分布，拥有藏传佛教所有教派，包括在西藏本土早已消失的觉囊派。
3、从地理区位、交通、经济发展总量以及文化形态等多方面综合考虑，其余各县均不适合。
4、马尔康市为阿坝藏族羌族自治州下辖县级市，藏语意为“火苗旺盛的地方”，引申为“兴旺发达之地”。
5、马尔康市是以原嘉绒18土司中卓克基、松岗、党坝、梭磨四个土司属地为雏形建立起来的，亦称“四土地区”。市区马尔康镇系阿坝藏族羌族自治州州府驻地，是阿坝州政治、文化、金融、信息中心。
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