先申请确认劳动关系！确认劳动关系后再申请认定工伤。
申请工伤认定三个必备要件中最主要的就是与用人单位存在劳动关系的证明。
要证明你是公司员工，有两个办法确认：一是申请仲裁确认劳动关系，二是向法院提起诉讼确认劳动关系，除此之外别无他法！
确认劳动关系期间，原则上工伤认定部门是不计入一年的时限的（工伤保险条例第二十条有规定：作出工伤认定决定需要以司法机关或者有关行政主管部门的结论为依据的，在司法机关或者有关行政主管部门尚未作出结论期间，作出工伤认定决定的时限中止）。
你尽快的在一年之内提起仲裁确认劳动关系，然后再申请认定工伤。只要你认定为工伤并申请做劳动能力鉴定，根据级别，赔偿金额是法定的，用人单位采用推诿方式不予赔偿或者不按规定数额赔偿是不行的。至于说通过法律仲裁会有什么影响，最严重的后果就是与用人单位解除劳动关系！
诸害相权取其轻，你自己权衡，在这里就不误导你了（当然如果你觉得愿意扯破脸来处理的话，那就请个人民律师吧）。
祝你好运！
个人观点，供参考。
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