（1）A表示水的光解，发生在在光反应过程中．根据水的光解的反应方程式，氧气来源于水．光反应产生的ATP用于暗反应三碳化合物的还原．
（2）C过程是葡萄糖分解成丙酮酸，发生在细胞质基质中．E过程表示有氧呼吸的第三阶段，需要养氧气的参与，光合作用中也能产生氧气．
（3）线粒体能发生有氧呼吸的第二和第三阶段，在有氧呼吸的第二阶段产生的气体是二氧化碳；叶绿体能够发生光合作用，在光反应中能够发生水的光解，产生氧气．
故答案为：
（1）光反应 水的光解 C3的还原
（2）细胞质基质 光合作用
（3）不一样 因为丙酮酸在线粒体中进行有氧呼吸，产生了CO2，而叶绿体进行光合作用产生O2．
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