A．分子、原子和离子是构成物质的三种基本粒子，故错误；B．分子是保持物质化学性质的最小粒子，院子是化学变化中的最小粒子，故错误；C．在化学变化中，分子可以分成原子，故错误；D．在化学变化中，分子分成原子，原子重新组合成新的分子，分子种类发生改变，故正确．故选D．
