把autodock对接后的结果保存出来，用DS里面的叠合功能把这些小分子和原始配体叠合一下就行了。 用PYMOL可以做的。将autodock的小分子导出PDB格式，大分子部分也导出PDB格式。在maestro中有merge这一项，整合成一个完成的complex形式。
