按照以下方式处理长期股权投资破产的清算：首先，自法院发布受理上市公司破产案件的公告当日起，交易所应当对进入破产程序公司的股票实施停牌。其次，公司应在收到法院有关法律文书的当日，立即向交易所报告，经交易所审查后公告。最后，法院依法宣告上市公司破产的，自法院发布公告日起，交易所对该公司股票停牌。
【法律依据】
《中华人民共和国公司法》第一百八十七条清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，发现公司财产不足清偿债务的，应当依法向人民法院申请宣告破产。公司经人民法院裁定宣告破产后，清算组应当将清算事务移交给人民法院。《中华人民共和国公司法》第一百九十条公司被依法宣告破产的，依照有关企业破产的法律实施破产清算。
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