1、“请问如何保护其合法权益”：让你爷爷带上自己符合廉租房的证明、老三不符合的证据、当初分房是分给你爷爷的证据、你爷爷并不知道房产过户给老三的证据等：到区廉租办、房管局去反映，请求更正房产登记。
2、如果房管部门不给办理变更登记：可以提起行政诉讼告房管局。
补充：
1、你的“怎么可以”、“怎么可能”无法回答，事实上，许多违法违规的事是如何能办下来的，只有当事人知道。你能做的，就是在知道那些事违规违法时，去争取纠正、维护自己的权利。
2、如果真有你爷爷的签名：又无法证明那签名是假的、不是你爷爷的真实意思时，很难再变更了。
3、按规定，廉租房不能买下产权，只有到一定年限后才可以，而且各地政策不统一。但有些违规有事情，就很难说清了。
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