医疗事故纠纷的处理程序如下：1 .经确认属于医疗事故的，医疗机构应当按照规定向当地卫生行政部门报告；2.当事人向卫生行政部门申请治疗的，应当提交书面申请；3.当事人可以自行协商解决，也可以通过人民法院调解或者判决解决。
一、医疗事故纠纷处理程序具体流程
根据《医疗事故处理条例》规定，解决医疗纠纷的方法有医患双方协商调解、申请卫生行政部门处理和向法院提起诉讼三种途径。而现实中，诉讼往往是医患双方解决纠纷的首选途径，患方在医疗纠纷中如何诉讼进行法律上的指导。1.诉讼前准备。发生医疗纠纷后，患者应立即与医疗部门联系投诉，要求复印病历，并与医疗代表一起封存病历(包括病历、住院病历、手术同意书、会诊讨论记录等。)，并向医务部索要《医疗纠纷投诉表》的收据。完成上述工作后，患者可以选择哪种法律途径解决纠纷。2.诉讼。诉讼立案后，法院会安排时间进行第一次开庭，主要是确认医患双方当事人的资格，并对双方提交的病历进行质证。第一次开庭后，将质证后的病历交由医疗事故鉴定委员会鉴定。3.医疗事故技术鉴定。这是医疗纠纷处理程序中最重要的环节，决定着整个医疗纠纷诉讼的大局。
二、赔偿标准
1.医疗费，医疗事故造成人身伤害的治疗所发生的医疗费用，按照凭据计算支付，但不包括初级医疗费用。结案后确需继续治疗的，按基本医疗费用支付。
2.工资损失，患者有固定收入的，按误工减少的固定收入计算，收入高于发生医疗事故上一年度职工平均年薪3倍的，按3倍计算；没有固定收入的，按照发生医疗事故上一年度职工年平均工资计算。
3.住院伙食补助，按医疗事故发生地国家机关一般工作人员出差伙食补助标准计算。
医疗纠纷诉讼不同于普通民事诉讼，医疗原则的灵活适用和法律适用是患者利益最大化保护的关键。因此，受影响方应考虑聘请精通处理医疗纠纷的律师代理相关法律事务。
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