差别在于目的性，致突变实验的目的是验证物质对生物遗传性的改变，遗传毒理实验是验证物质对于生物遗传物质的损害及因此引起的对生物的毒害作用。简单来说，致突变实验研究的是因果，什么物质导致了哪些结果，遗传毒理实验研究的是过程，什么物质怎么导致了那些结果（生物的遗传突变往往对于生物自身是有毒害性的，因此此两种实验无论实验过程还是结果以及记录数据往往很接近或相同）。
