转录组测序中,Q20、cycleQ20和平均Q20这几个概念间的区别与联系

只知道这是衡量测序数据质量的,但不太清楚具体含义,请赐教
2025-03-10 11:37:49
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回答1:

Q20是测序质量质控值,其实就是-10log10(P)。转化来说也就说错误的可能性为0.01,即1%。一般Q20只是一个质量控制值
cycle Q20的意思:
首先你要明白cycle的意思,即每个测序中的其中的一个循环,比如你在转录组测序2X100模式中,第20个cycle也就是第20个碱基的测序循环。所以cycle Q20也就是某个碱基位置(也可以理解为第几个测序循环)所有质量值的平均值。
平均Q20很好理解,即所有测序的碱基的碱基质量的平均值,有时候也表示所有reads的质量。
大概就是这样。