A、无氧呼吸的场所是细胞质基质，酵母菌无氧呼吸的产物是酒精和二氧化碳，而乳酸菌无氧呼吸的产物只有乳酸，可见两者在细胞质基质内的反应不一样，A错误；B、乳酸菌是厌氧菌，因此在制作酸奶时不需通气，B错误；C、酵母菌和乳酸菌在生态系统中都是分解者，可见两者的作用相同，C错误；D、酵母菌是真核生物，乳酸菌是原核生物，原核细胞与真核细胞相比，最大的区别是原核细胞没有核膜，D正确．故选：D．
