自制付款凭证是相对外来的发票、收据等有效凭证而言的。一般是经济组织内部使用的并认可的会计凭证。至于钱从哪里来，要看具体的业务规定了，和自制凭证与否没关系。
是从学校给你导师的科研经费中扣，不是从导师工资中扣。
你这个问题有点奇怪，付款凭证就是付款申请的单子吧
