根据《中共浙江省委办公厅浙江省人民政府办公厅关于印发〈温州市人民政府机构改革方案〉的通知》（浙委办〔2011〕36号）精神，设立温州市交通运输局。市交通运输局是主管全市公路、水路，航空，港口，铁路等交通运输行业的市政府工作部门。
