患鸭病毒性肝炎的雏鸭肝脏肿大，表面有出血点或出血斑，而患沙门氏菌病的雏鸭的肝脏也肿大，呈红色或古铜色，表面有灰白色的小坏死灶，这是两种病在病理变化上的重要鉴别之一；将肝脏等病料触片染色镜检和接种于麦康凯琼脂培养基，鸭病毒性肝炎均为阴性，而鸭沙门氏菌病均为阳性，是鉴别之二；临诊上应用抗生素不能控制鸭病毒性肝炎的发生和流行，而抗血清和卵黄抗体能有效地控制鸭病毒性肝炎的发生和流行，用抗生素能控制沙门氏菌病的发生和流行，是重要鉴别之三。必要时可作病原的分离和鉴定。
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