父母户口不在一个户口本上，证明亲属关系，可以用结婚证和身份证进行证明。这样，只要可以对应证明是夫妻关系，也就证明了父母子女之间的关系。至于在何处进行公正，就要看在哪里需要这样的关系证明，那就在那里进行公正
一般要开证明的话根据对方所需要提供的证明去办理就好了，应该要结婚证，及户口本(有你的户口的本)，公正的话一般要本地的公正
你可以采取公证的方式证明亲属关系，实在不行，还有鉴定。
