柑橘蒂腐病的两种症状都是由真菌引起的。黑色蒂腐病病菌通过雨点溅散到果实上，病菌潜伏在果萼与果皮之间，在适宜条件下通过伤口、特别是果蒂剪口侵入。褐色蒂腐病病原菌在病枯枝、病树干及死树皮上越冬。生长期间侵入果实，储藏运输期间若温度高、湿度大、伤口多，便极易引起严重蒂腐。蒂腐病发病最适温度27～28℃，以28～30℃时腐烂最快，在20℃以下或35℃以上时腐烂较慢，5～8℃不腐烂。
