A、噬菌体是DNA病毒，只含有DNA，A错误；B、人体只有有氧呼吸第二阶段能产生二氧化碳，场所是线粒体，B错误；C、神经细胞已经高度分化，不再分裂，不会出现染色体，C错误；D、同一个体的不同细胞是受精卵分裂分化形成的，而细胞分化的实质是基因的选择性表达，所以同一个的不同细胞中，DNA相同，但RNA和蛋白质有所区别，D正确．故选：D．
