迫于以美国为首的北约强大的武力介入与威胁，最终米洛舍维奇接受了北约开出的条件，科索沃解放军必须解除武装，停止军事行动。南联盟则从科索沃撤军，允许阿尔巴尼亚人回乡重建家园，并接受联合国维和部队的监督（北约可在联合国旗帜下参与），于是科索沃战争宣告终止。塞尔维亚自此失去对科索沃的控制权，但至今坚持拥有主权。
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