要求贮藏的相对湿度保持在60-90%。
过去贮藏干花椒，一直采用麻袋盛装，普通库房贮藏。用这种方法贮藏的花椒弊病很多。时间一久，麻味降低，芳香减少，颜色减退。一至高温雨季，花椒吸水后，油质水解霉变，不仅花椒的品质下降，甚至不能食用。近年来采用“花椒低温低湿密闭贮藏”的新方法，克服了过去那种贮藏法的缺点。
花椒干制后，用0.20-0.24毫米厚的聚乙烯塑料薄膜袋盛装。密封后（既可防潮，又可减少袋内氧气，有利于贮藏）贮藏于1-5℃的低温库房内。同时，要求贮藏的相对湿度保持在60-90%。
若花椒的数量不多，不足以设专库贮藏，就可将花椒装入0.20-0.24毫米厚的塑料薄膜袋密封，存放于冷凉的地下室或通风的房间里贮藏。
贮藏少许花椒，可盛放在有盖的广口玻璃瓶内，盖严，存放于温度较低的室内，随用随取。每次用后要盖严，既可防止花椒的芳香气味挥发，又可防止吸湿受潮。
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