医院始终贯彻“科技兴院、质量建院”的方针，鼓励广大医务人员结合临床工作的实际开展医学科学研究，有31项科研成果获厅级以上科技进步奖，已鉴定成果12项，在省级及以上学术刊物发表论文900余篇，研制开发两种国家三类中药新药并获批准文号。2001年医院出台了《山东省交通医院专业技术拔尖人才选拔和管理暂行办法》，以鼓励更多的专业技术人员钻研业务，攀登技术高峰。医院有一人享受国务院特殊津贴，一人获山东省富民兴鲁劳动奖章，两人被评为全省交通系统劳动模范，三人被评为院科技拔尖人才。
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