应缴预算款与应缴财政专户款这两个“应缴”既有相同点，又有不同之处，相同点：是事业单位按财政部门规定应缴预算的资金、应缴财政专户的非税收入、均为财政性资金，应日清月结，且年终必须全部结算清缴，不留余额。
不同之处： 应缴预算款是行政事业单位在业务活动中按规定取得的应缴财政预算的各种款项，主要包括纳人预算管理的政府性基金、行政性收费、罚款、没收财物变价款、无主财物变价款及其他应缴预算的资金等。行政事业单位对于应缴预算的收入，应及时足额上缴，不得挪用，不得隐瞒，不得以任何借口截留开支或转作其他。
而应缴财政专户款科目是指事业单位按规定代收的应上缴财政专户的预算收入,应上缴财政专户的预算外资金范围按财政部门的规定办理。也就是说应缴财政专户款是事业单位特有的,按国家有关政策纳入财政综合预算管理的资金。
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