蓝鳍金枪鱼常以50—60尾成群，也有1000尾以上的鱼群。栖息水层从表层至50米深层，最适宜水温10—20℃，饵料以鲱鱼、沙丁鱼、鲐鱼、鱿鱼和甲壳类为主。这种鱼很有规律地往返于美洲和欧洲之间，它的两个种群都已经被过度捕捞。墨西哥湾是已知的两个大西洋蓝鳍金枪鱼产卵地之一，英国石油(以下简称BP)的原油泄露事件让蓝鳍金枪鱼的处境雪上加霜。据估计，这种处于生态危机中的金枪鱼在北美的种群数量只剩下9000条左右。
