用于基因工程的许多质粒载体含有编码抗生素抗性的基因,如pBR322携带有氨苄青霉素抗性基因(amp)和四环素抗性基因(tet)。这些基因作为载体的标记,其中一个(如amp)可以用来选择转化子。因转化子能在含有抗生素的琼脂糖培养基上形成菌落,而非转化的细胞被杀死。另一个基因(如tet)可以用作重组的质粒载体的标记,因为目标序列插入此基因导致插入失活。因此,用重组质粒转化的细胞仅对amp有抗性,而环状(天然)质粒转化的细胞对amp和tet都有抗性。
区分这两类转化体的一种方法是使用复制平板:
转化体首先放在含氨苄青霉素的琼脂培养基的培养皿上生长,过夜培养后,两种类型的细菌均会产生单一的菌落。
2. 将一张无菌茸板轻轻压在培养皿表面,使一些细胞转移到板上。
3. 将板上的细菌接种在含有四环素的琼脂培养基上(即一个复制平板):任何仅能在第一个平板上生长的菌落一定来源包含有重组质粒的细胞。这些菌落可用于筛选特定的目的DNA(如使用免疫技术)。
PUC系列质粒比pBR322系列质粒的应用更广泛,这种质粒具有以下优点:
拷贝数:每个细菌细胞中存在着几千个相同拷贝的质粒,提高了质粒DNA的产量。
2. 重组子的“一步选择”:这种质粒携带有氨苄青霉素抗性基因,并在β-半乳糖核苷酶的基因含有一个多克隆位点。β-半乳糖核苷酶基因的插入失活可以被包含有一种合适的酶诱导物(如异丙醇基硫代半乳糖苷)和生色底物5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷(Xgal)的琼脂培养基检测到。来源于有质粒的细胞的菌落呈蓝色,而含有重组分子的菌落呈白色。另有一些质粒使用不同的标记物,如荧光素酶基因可以在荧光素底物的存在下通过生物发光检测到。