法律承认的是当初注册公司时签订的章程和股东会决议。如果想改的话,最好是到工商做一下变更。
不管签什么东西哦,个人觉得如果说牵扯到利益的,最好公证下,但是又因为你们的章程有问题哦,就不知道公证处会不会受理。如果说你们资金有的话,就再重新分好股份,再做一次增股这类的手续,这样也就不用再签什么协议了~~