维持蛋白质三级结构的主要键是次级键，包括离子健、疏水键、范德华力等。
蛋白质三级结构：指一条多肽链在二级结构或者超二级结构甚至结构域的基础上，进一步盘绕，折叠，依靠次级键的维系固定所形成的特定空间结构。
特点
1、含多种二级结构单元；
2、有明显的折叠层次；
3、为紧密的球状或椭球状实体；
4、分子表面有一空穴（活性部位）；
5、疏水侧链埋藏在分子内部，亲水侧链暴露在分子表面。
