A、双链DNA分子中一条链上磷酸和脱氧核糖是通过磷酸二酯键连接的，A错误；B、某个体的神经细胞与肌肉细胞在功能上不同的主要原因是基因选择性表达的结果，B错误；C、马和豚鼠的性状差异很大，根本原因是DNA分子中碱基对排列顺序不同，体现了不同生物DNA分子的多样性，C正确；D、真核生物基因表达时，翻译的场所只有核糖体，D错误．故选：C．
