根据《城镇企业职工基本养老保险关系转移接续暂行办法的通知》，参保人员流动就业，同时在两地以上存续基本养老保险关系的，在办理转移接续基本养老保险关系时，由社保经办机构与本人协商确定其中一个基本养老保险关系和个人账户，同时其他关系予以清理，个人账户储存额退还本人，相应的个人缴费年限不重复计算。
像你的情况， 及时重复缴纳，也是单位承担的， 不会由你承担单位的部分。
现在来说，最好还是通过单位，到现在的参保社保中心，把这三个月办理退出手续。
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如果重复缴费，只能放弃其中的一段。
退出个人账户的钱。
不能累计计算。
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