一、建立时间不同
1、中国科学院：成立于1949年11月。
2、中国科学院大学：前身是1963年开始试办的中国科学院研究生院，1978年正式建校。
二、性质不同
1、中国科学院：为中国自然科学最高学术机构、科学技术最高咨询机构、自然科学与高技术综合研究发展中心。
2、中国科学院大学：是一所以科教融合为办学模式、研究生教育为办学主体的创新型大学。
三、地理位置不同
1、中国科学院：北京市三里河路52号。
2、中国科学院大学：中国北京市石景山区玉泉路19号（甲）。
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