基本是不合法的，年休假是全薪的，天数是法定的，扣减没有法律依据。至于工伤的停工留薪期或者医疗期有法定的天数，工资标准也是法定的，各城市都有自己的工资支付条例中会明确，婚丧假一般没有强制的标准，也不会扣除的，至于生育假是全薪的。不管规章制度怎么规定和法律法规冲突的部分是无效的，公司也需要说明自身规定的合理性。建议您看看您所在城市的工资支付条例或办法之类的政策法规。都有很明确的计算标准。有争议的时候，具体的法规是优先适用的。劳动法只是原则规定，各地的标准非常详细，您可以自己对照下。
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