消化内科系第一批绍兴市临床医学重点学科。拥有全省高清晰度电子胃镜及电子结肠镜、电子十二指肠镜、超声内镜及主机、幽门螺杆菌C14同位素呼气试验仪等。设有门诊、病区、内镜中心及消化内科实验室各1所。率先在绍兴市内开展消化系疾病的内镜下治疗及介入治疗,多项技术绍兴市内领先,包括经内镜治疗胰胆管疾病、金属支架植入术治疗消化道恶性狭窄、结合超声内镜胃肠道肿瘤及早期胃癌、大肠癌的内镜下切除术等。多项科研成果先后获省、绍兴市医学科技进步奖。是集消化内镜诊治、介入放射诊治、介入超声诊治为一体的学科群体。