不影响。考生填报高校专项计划相当于给考生增加了一次录取机会，未录取不影响后面志愿的填报。不填报或填报未入围高校专项计划，视为放弃该项招生资格，但不影响其他志愿录取。高考是按批次录取的。高校专项计划被退档不会影响本科一批次的录取。
