线粒体、叶绿体都含有核糖体，所以能合成部分蛋白质。但它们的蛋白合成能力有限，大量蛋白质还是在细胞质中合成，然后定向转运到线粒体、叶绿体。转运机理也都相似，主要依靠前体蛋白n段的信号序列。如果想了解更多，可以看看细胞生物学教程。
叶绿体和线粒体都有各自完整的酶系，有猜想说线粒体和叶绿体在远古时代都是两种生物，后来由于共生关系和在细胞融合在一起组成了今天的细胞体系。有一定的道理。
