A．1H2与2H2是单质不是原子，不为同位素，故A错误； B．O2与O3都是由氧元素形成的结构不同单质，互为同素异形体，故B正确；C．正丁烷和异丁烷分子式相同，结构不同，互为同分异构体，故C错误；D．乙烷与乙烯分子式不同，结构不同，不为同分异构体，故D错误．故选B．
