根据总体规划，保护区于2003年开始实施基础设施建设工程。2004年，已建立保护区科教综合楼一座，面积为2300平方米。建立长岭保护管理站、唐田保护管理站和5个保护点，保护站点建筑面积1000 平方米。保护区内设置各种宣传牌、标志牌200块，埋设界桩500根。配备巡护管理车1辆，巡护快艇1艘、机动船1艘。架设供电、通讯线路24K米。保护区管理能力得到显著提高。
2006年，保护区已成为安徽大学的教学科研基地，并与国际鹤类基金会、东北亚鹤类网络、东亚-澳大利亚涉禽网络组织保持沟通与接触，越来越多的科研机构和科研工作人员来到升金湖进行科研和考察活动。
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