一般不建议挤压载玻片和盖玻片。一来挤压玻片容易造成盖玻片碎裂，伤害样本甚至镜头；二来水中微生物有单细胞层和多细胞层的，单细胞层无需挤压一般也能看清楚，多细胞层挤压会破坏其原有结构，也很难通过挤压玻片而增加清晰度。
